Псковская таможня осуществляется дополнительный фитосанитарный контроль ввозимой продукции на предмет вредителей и возбудителей болезней, которые распространяются в результате импорта семян и продуктов аграрного сектора. Санитарный контроль осуществляется при транспортировке животных. Сотрудниками таможни запрещается ввоз партии овощей, рыбы, животных, если нет соответствующего ветеринарного заключения. Таможенники имеют право оставить партию на карантин для выявления случаев заражения.